臼式研磨仪是按照研钵和臼杵的外形来制造的设备，其工作时也是模仿人工进行臼式粉碎，利用挤压力和摩擦力对样品进行研磨。这种研磨方式出料粒度较小，且均匀性也可以，但是每次只能处理一个样品，单次研磨的样品量也较少，且如果研磨土壤等一些不能受二次污染的样品，就需要更换整套研磨器具，成本相当高。
臼式研磨仪研磨钵以一定的速度转动，研磨杵位于研磨钵偏心的位置。将待处理的样品通过顶部的进料窗倒入研钵和杵头之间的粉碎区，样品在研磨钵的内表面与杵头之间被挤压和摩擦粉碎，同时在研磨钵与杵的底部进行粉碎和搅拌。研磨钵上的刮板可以保证样品在每一个研磨周期内都被粉碎，使样品的均匀性得以保证。
臼式研磨仪主要优点和性能：
1.容易清洗
2.适合干磨、湿磨、冷冻研磨
3.不锈钢外壳
4.对于粗糙的样品可选择预处理
5.在研磨过程中能够通过进料窗增加样品量
6.刮板材质具有广泛的选择性能够满足所有应用任务（聚氨酯、聚四氟乙烯、榉木）
7.研钵和杵头的位置无需工具即可调节移动
8.刻度调节使杵头能够准确和可重复性设置
9.数字时间和速度的设置
10.转速在50-130rpm范围内可调，适用于热敏性不同的样品，使研磨结果准确及优化
11.研磨工具研体和杵头材质具有多重选择性，能够满足所有应用任务
