冷冻研磨仪可有效抑制核酸的降解，保持酶的生物活性，在新鲜动植物细胞组织中的核酸和蛋白质提取的样品前处理。而人类的骨骼和牙齿在传统的方中是很难被压碎的，特别是当它们还是新鲜的时候。然而，骨骼材料却是可以在低温下进行内含DNA的提取的。
塑料品、聚合物的成分分析。塑料、树脂、纺织品和高分子材料等在室温下是很难被成功研磨的，但在低温下就会被易研磨，同时还可避免了样品在研磨时，温度升高对样品分子结构和组成的影响；同时采用低温冷冻研磨仪对塑料样品还可以进行快速、无污染的研磨处理，能够大大提高塑料品、聚合物等的实验分析和测试速度。
冷冻研磨仪对温升的控制原理可分别分为风冷温度控制、预冷冻温度控制和水冷温度控制三种，因此又称为低温研磨机。其组织研磨设备主要是在传统实验室球磨机的基础上增加温度控制处理的样品研磨预处理仪器，使其低温冷冻研磨法能够实现样品在低温环境或室内恒温条件下的细磨和其低温研磨，使其冷冻组织研磨仪在对热敏性、热塑性延展性、纤维性、含糖性等难研磨样品前可正常操作对试样的前处理实验分析。
在研磨设备的运转过程中，磨球在球磨罐内的高频率冲击与摩擦，可产生大量的热量，使磨罐内的温度升高，但温升的出现会使试样的成分发生变化，其磨研时间越长，热量越多；为避免样品在研磨过程中出现性质的变化，因此需要其研磨环境的温度进行控制，避免温升的出现。
避免温升出现的方法操作，无法是将其试样及离心管适配器在液氮中进行液氮，快速研磨试样，减少样品研磨时间；或者应用冷冻研磨设备，使其研磨环境始终处于低温环境，就杜绝了在使用过程中有可能出现的升温现象。
