1、微量氧分析仪的配套管线应确保密封，微小的泄漏都会使环境空气中的氧扩散进来，从而使测量数值偏高。
虽然在测量中，样气压力大于环境压力，但样气中的氧是微量级的，根据法拉利定律，氧的分压与其体积含量成正比，大气中含有约为21%的氧，与以PPM计算浓度的样气的氧分压相差一万倍左右，因而气样中微量氧的分压远低于大气中的氧分压，当出现泄漏时，大气中的氧便会从泄漏部位迅速扩散进来。
还有，取样管线应尽可能短些，接头尽可能少，要保证接头及阀门密封良好，管线连接完毕后，应做气密性检查。管线的缩短有利于减少检测的滞后时间
2、微量氧分析仪管线材质基本上以铜质或不锈钢管线为好，次选聚四氟乙烯管。禁选乳胶管、白胶管之类管材，其气密性和材质抗渗透性太差，测量微量氧在标准测量压力下误差太大。所选择的阀门、接头，应尽可能小。3、微量氧分析仪测量的样品气中不能含有油类组分或固体颗粒物，以免引起渗透膜阻塞和污染。
4、微量氧分析仪测量的样品气中不应含有硫化物、磷化物或酸性气体成分。这些组分会对燃料电池造成危害。
5、被测气体温度不能高于40度，否则会加速老化微量氧分析仪燃料电池传感器，在20度时比40度时寿命提高26%
