反相色谱在高效液相色谱仪中是应用广泛的技术主要是因为它适用于分析极大多数的非极性物质和离子化合物大多数用于反相色谱的固定相都是天然的疏水物质，因此分析物是按照它们与固定相的疏水相互作用的大小来分离的。
反相柱分析物和固定相的基质污染可在使用期间受到影响，应注意的是，固定相逆变器的特殊性质可与由柱压污染问题分析物相互作用的是结果在分离检测过程因子反相柱污染有哪些呢？
（1）在高效液相色谱仪反相色谱柱上有自己很多不同填料主要包括一些聚合物聚合物材料表面涂上硅胶和氧化铝，无机－有机混合物涂层氧化锆和石墨化碳都存在于我们这些键合硅胶上,为增加一个反相色谱柱的应用常利用企业各种社会流动相和添加物作用于反相色谱柱添加物,可以通过改变或修饰填料的表面工作有时候甚至可能会造成污染键合相表面硅胶表面的疏水键合相是硅烷醇残留的硅烷醇存在于所有的硅胶键合填料中对于这些硅烷醇具有弱酸性，因此他们能与某些待分析物反应能力成为基质细胞成分。
（2）样品中含有的盐、脂质、含脂物质、腐质酸、疏水蛋白质和其它一些物质是一些可能在使用时与HPLC柱发生相互作用的物质部分非常疏水的样品基质，如玉米油，高芳香物质和蜡能粘住固定相装填表面并且改变其性质,含有蛋白质物质的生物流体也能吸附在填料表面。有些物质有比待测物或少或大的保留值，那些保留值较小的物质如盐类一般来说在空体积时就被冲出色谱柱，这些非目标产物的被检测器检测到而且能形成色谱峰,气泡,基线上移或者是负峰如果样品成分在柱子中有很强的保留而且流动相溶液成分不足以把这些物质洗脱下来多次上样后，这些吸附在柱子表面的物质通常就会积累在柱头这些行为通常只有通过平行实验才能发现有着中等保留值的样品能被缓慢洗出而且表现为宽峰，基线扰动，或者基线漂移。
