工业冷水机冷却器系统通过真空测试后，可以使用系统中的真空状态填充制冷剂。制冷剂充填,对于新安装的系统，可以将制冷剂添加到高压端，其操作方法如下：打开冷凝器的冷却水系统，并在真空测试期间将阀门保持在系统中。用西14mm×2mm无缝钢管将钢瓶与制冷剂连接（注满氟利昂时使用铜管）。瓶子的嘴向下倾斜，圆柱体与地面成30度角，或者圆柱体的末端抬起200-300mm。

工业冷水机打开加油阀。当系统达到一定压力时（氨系统为0.1〜0.2 MPa；氟利昂系统为0.2〜0.3 MPa），停止填充制冷剂，然后在每个连接和焊接处检查系统的密封状态。如果没有泄漏，可以继续填充制冷剂。关闭蓄能器上的出口阀，并继续填充制冷剂。当气缸压力和蓄能器中的压力达到平衡时，应打开蓄能器上的出口阀。

工业冷水机在继续填充制冷剂的同时，启动制冷机以使制冷装置进入运行状态。当气缸下部出现白霜时，表示气缸中的液态制冷剂几乎充满。此时，工业冷水机可以关闭气缸阀和充气阀，并且可以更换瓶子以继续充气。除非外部温度非常低，否则在填充制冷剂时通常无需在缸体上倒热水以增加缸体内的压力，因为这样做不安全。如果需要加快填充速度，热水温度不应超过50℃，并且严禁使用其他方法加热气瓶。

填充氟利昂时，工业冷水机必须在专用连接管上安装干燥过滤器，以减少水进入系统的可能性。在高压部分充气时，切勿启动压缩机，并注意排气阀不要泄漏，否则会引起液体冲击。当制冷剂填充量达到填充量的90％时，可以暂时停止填充，可以对系统进行测试以检查系统剂量是否满足操作要求，并避免因过度填充而造成不必要的麻烦。对于旧的工业冷水机制冷系统，当需要补充制冷剂时，应从低压侧进行填充。