紫外线消毒器的机制是微生物的DNA受到紫外线照射后生成胸腺嘧啶二聚体，致使自身不能复制而死亡或被菌体免疫系统消灭。目前的研究表明，光复活以后的活性和增值能力能够得到显著提高。UV-氯消毒具有较好的灭活效果并能控制光复活。当UV照射剂量为5.4 mJ/cm2、投加2.5mg/L的氯并反应10 min后，出水大肠菌群<20CFU/L，且无光复活现象。再生水紫外线消毒器、中水紫外线消毒器、污水紫外线消毒器、污水排放紫外线消毒器和消毒副产物的形成污水中含有较多的有机物，采用加氯消毒时，不但消耗更多的有效氯而且会生成三卤甲烷(THMs)类致癌副产物。紫外线消毒不会产生副产物，随着辐照剂量的增加，水中甲醛的含量会略有升高，但仍低于GB18918-2002规定的300μg。