超净工作台原理是在在特定的空间内，室内空气经预过滤器初滤，由小型离心风机压入静压箱，再经空气过滤器二级过滤，从空气过滤器出风面吹出的洁净气流具有一定的和均匀的断面风速，可以排除工作区原来的空气，将尘埃颗粒和生物颗粒带走，以形成无菌的高洁净的工作环境。

从气流流向分为：垂直流超净工作台和水平流超净工作台；超净工作台从操作人员数上分：分为单人工作台和双人工作台；超净工作台从结构上分：分为常规型和新型推拉以及自循环型（垂直流）。 超净工作台根据气流的方向分为垂直流超净工作台和水平流超净工作台，垂直流工作台由于风机在顶部所以噪音较大但是风垂直吹多用在医药工程这样保证人的身体健康；

水平流工作台噪音比较小风向往外所以多用在电子行业，对身体健康影响不大。根据操作结构分为单边操作及双边操作两种形式，按其用途又可分为普通超净工作台和生物（医药）超净工作台。